본 대학교의 입교정신에 입각하여 재학생에게 공정하고 효율적으로 장학금제도를 운영하고 있다. 장학금은 성적우수자를 위한 장학금이 있고 또한 장학금이 꼭 필요한 학생에게 지급되도록 하자는 원칙하에 가계곤란자를 위한 장학금이 있어 연세대학교에서 학비가 없어 대학교육을 받을 수 없는 경우는 더 이상 없다.
학교 전체 장학금은 학부의 경우 전체 학생의 약 40%, 대학원의 경우 약 75%의 학생들이 수혜하고 있으며 생명시스템대학의 경우 이보다 수혜율이 훨씬 높아 학부의 경우 약 60% 이상, 대학원의 경우 전원이 장학금을 수혜하고 있다. 또한 극소수의 매우 우수한 학생에게만 지급되는 대통령 장학생, 연세 우수 장학생 등의 수혜율에 있어서 최고 수준을 보이고 있다.

연세 창립 120주년을 기리기 위해 마련된 장학제도로 매년 120명을 선발하며, 국민기초생활수급자로서 연세 한마음 장학전형에 합격한 학생에게 혜택이 주어진다.(졸업할 때까지 등록금 전액과 도서비 지급) 또한, 차 상위 계층을 비롯한 기타 저소득층의 자녀에게도 매 학기 등록금 전액의 장학금을 지급한다. (입증서류 제출 요) 이로써 연세대학교에서는 절대적 빈곤층의 자녀들도 졸업할 때까지 안정적으로 학업에 전념할 수 있는 장학제도가 확립되었다.

직전 학기 이수 학점이 12학점 이상이며 학업성적이 평량평균 2.50이상인 학생을 대상으로 가계곤란(등록금전액, 반액)과 성적우수(등록금전액, 반액, 1/3)로 지급함. 신청방법은 학교홈페이지, 방송국(YBS), 연세춘추, 각 단과대학 게시판에 공고하며 매 학기말 시험 개시일 이전에 소속 단과대학이나 학과 사무실에 신청하여 대학장의 추천을 받아야 한다.

1. 장학금 지급 원칙
   기회가 균등하게 주어져야 함. 실질적인 도움이나 명예가 되어야 함. 장학금 수혜에 대한 감사의 마음을 가질 수 있어야 함.
2. 장학금 지원 기간
   다양한 전형으로 신입생을 선발하기 때문에 신입생들의 성적을 객관적으로 비교할 수 없음. 따라서 신입생 중에서 장학생을 선별하는 것은 실질적으로 어려움. 따라서 신입생을 제외한 모든 학생 중에서 선별하여 두 학기를 지원함. 매년 지난 두 학기 성적의 평균을 바탕으로 두 명을 선발하여, 일정 정도의 성적(3.5이상)이 유지되면 다음 학기(최대 1년)까지 등록금 전액을 지원함.
3. 선발 기준
   가정형편이 여유롭지는 않지만, 국가장학금을 받을 정도로 어렵지는 않고 학업성적이 우수한 학생을 선발함. 직전 두 학기의 성적이 전체의 10% 이내에 속한 학생 중, 타 장학금을 수혜하지 않고 가정의 경제적 여건이 좋지 않은 학생, 의치학 전문대학원이나 약학대학 진학희망자는 제외함(면담을 통해 확인 필요).
4. 지원 방식
   학생들이 정기범 장학금을 별도로 지원하는 것이 아니라, 대상 학생 후보군을 학과에서 선별한 후 가정의 경제여건을 판단할 수 있는 서류를 제출하고 면담을 통해 선발.
5.  

특정분야에 탁월한 신입생을 대상으로 등록금전액 및 교재대금을 지급하고 특수관리 및 육성 지도한다.

기초학문 분야의 재학생 또는 국가고시 1차 합격자를 대상으로 성적과 가정형편을 고려하여 선발, 등록금 전액 및 교재대(월50만원)를 지급한다.

입학당시 선발하며, 매 학년도 신입생 모집요강에 명시한 바에 따라 시행한다.

재학 중 사법, 행정, 외무, 기술 고등고시, 지방고등고시 또는 이에 준하는 시험의 1차 합격자와 공인회계사, 변리사, 최종 합격자에게는 고시장학금(80만원)을 합격한 다음학기에 1회에 한하여 지급한다.

재학 중 사법, 행정, 외무, 기술 고등고시, 지방고등고시 또는 이에 준하는 시험의 1차 합격자와 공인회계사, 변리사, 최종 합격자에게는 고시장학금(80만원)을 합격한 다음학기에 1회에 한하여 지급한다.

총학생회 및 학생 자치 기구에서의 봉사 활동을 통하여 학교 발전(학생 활동)에 기여하는 학생에게 지급하는 장학금이다.

연세 춘추사 기자 및 교육방송국 기자로 종사하는 학생에게 일정액의 장학금을 지급한다.

생활 협동조합에서 매 학기 출자하는 장학금으로서 학업성적이 2.50이상으로서 생협에 출자를 한 학생으로 가정형편이 곤란한 자를 대상으로 한다.

교직원 직계 자녀로 학업성적이 2.00이상인 학생에게 지급하는 장학금이다.

매 학기 장학복지부에 신청하여 선발이 되면 교내 각 부서에 배치되어 근로를 하는 학생에게 지급한다.

본교 동문, 개인 독지가의 기금에 의하여 지급되는 장학금으로 국회연세, 연세라이온스, 조요한 부처, 이종흡, 박정옥, 백학 외 260여종이 있으며 기탁자의 뜻에 따라 해당대학에서 추천을 받아야 한다.

이공계 대학 신입생 중 우수학생(성적우수 · 저소득층 학생 중)을 선발하여 정부에서 지원하는 장학금

본 대학교의 추천이나, 교외 장학 재단에서 지정하거나, 개인으로부터 지급되는 장학금으로 관정 이종환 재단, 동부 문화재단, 롯데 장학재단, 방일영 장학재단, 엘트웰 민초 장학재단, 송원 장학재단 외 130여종이 있음. 장학금 지급기간 : 1년 또는 졸업 시까지 지원(장학재단마다 차이가 있음)