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- 삼성바이오에피스, 올해도 산학협력 계속 "바이오 인재 조기 양성"
- 삼성바이오에피스가 지난 6일 서울 서대문구 소재 연세대학교 신촌캠퍼스에서 '연구노트 경진대회' 시상식을 개최하고 기념 사진을 촬영하고 있다./사진제공=삼성바이오에피스 삼성바이오에피스는 지난 6일 서울 서대문구 소재 연세대 신촌캠퍼스에서 '연구노트 경진대회' 시상식을 개최하고 연세대 생명시스템대학 학부·대학원생에게 우수 상패와 함께 1000만원의 장학금을 전달했다고 7일 밝혔다. 연구노트는 시작부터 결과물 보고, 발표, 지적재산권 확보 등에 이르기까지 전 과정에서의 연구 성과를 기록한 자료다. 연구노트는 연구의 지속성 유지, 결과 보호, 논문 발표, 특허 출원 시의 기초 자료로 활용된다. 삼성바이오에피스는 국내 주요 대학교와의 협약을 통해 연구노트 작성법을 교육하고 별도의 시상식을 통해 우수 학생에게 장학금을 지급하고 있다. 이를 통해 미래 바이오산업을 이끌어 갈 인재를 조기에 양성하고 대학에서 글로벌 수준의 연구개발 노하우를 미리 습득할 수 있는 학습의 장을 마련하고 있다. 강대성 삼성바이오에피스 인사팀장 상무는 "글로벌 기업과 대학 간의 폭넓은 학술 교류가 상호 지속가능한 발전으로 나아갈 수 있도록 업계의 특성을 살린 산학협력 활동을 올해도 꾸준히 확대할 계획이다"고 전했다. 양성욱 연세대 시스템생물학과장 교수는 "삼성바이오에피스와의 협력을 통해 진행하는 연구노트 경진대회를 비롯한 다양한 산학협력 프로그램은 학생들에게 중요한 학문적 도전과 기회를 제공해 미래 바이오 인재로 성장할 수 있는 밑거름이 될 것"이라고 했다. 삼성바이오에피스는 2015년부터 국내 8개 대학교와 산학협력 협약을 맺어 글로벌 시장에서 쌓아 온 바이오의약품 연구 개발 역량을 대학에 전파하고 있다. 동시에 바이오의약·임상의학 프로그램 운영 등 업계 전문성을 살린 다양한 산학협력 활동을 전개하고 있다. 구단비 기자 kdb@mt.co.kr https://v.daum.net/v/20250107084127401
- 시스템생물학과 관리자 2025.01.07
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- 정효빈 교수, 포스코 청암재단 ‘2025 사이언스 펠로십’ 선정
- 시스템 생물학과 정효빈 교수가 제 16기 (2025년) 포스코 사이언스 펠로십’ 에 선정되었다. 포스코 사이언스 펠로십은 국내 대학과 연구소에서 수학, 물리학, 화학, 생명과학 등 4개 기초과학과 철강, 신소재, 에너지소재 등 3개 분야의 응용과학을 연구하는 신진교수를 선발하여 최대 2년간 1억 원을 지원하는 프로그램이다. 지난 10월 24일 목요일에는 서울 포스코센터 서관 4층 아트홀에서 증서 수여식이 진행되었다. 우리 학과의 정효빈 교수는 올해 초에 시스템생물정보학 연구실을 과학원 S104호에 새로이 오픈하여 포스코 사이언스 펠로십을 발판 삼아 대학원생 연구원들과 함께 차세대 단일세포 멀티 오믹스 분석을 통한 암의 진화에서 후성유전체/유전체의 상호작용 연구에 집중할 계획이다.
- 시스템생물학과 관리자 2024.11.03
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- 김지현 교수, 연세 이윤재 펠로우 교원 선정
- 우리 대학 시스템생물학과 김지현 교수가 2024년 5월11일 백주년기념관에서 개최된 연세대학교 창립 139주년 기념식에서 작년에 신설된 'Yonsei Fellowship(연세 월드-클래스 석학교수 양성 프로그램)'에서 각 전공 분야의 선도 연구자로서 연세대의 국제적인 연구 경쟁력에 크게 기여했을 뿐만 아니라 학부 교육 등 모든 면에서 탁월한 교원에게 주어지는 '연세 이윤재 펠로우(Yonsei Lee Youn Jae Fellow)'로 선정되었다. [사진 좌측부터: 윤동섭 총장, 김지현 교수, 이윤재 의장] 생명시스템대학 시스템생물학과 및 대학원 생명과학부 교수로서 대학교부설 연구기구인 마이크로바이옴연구원 원장을 맡고 있고 한국과학기술한림원 정회원이기도 한 김지현 교수는 대통령표창, 과학기술정보통신부 장관표창, 대한민국학술원상(자연과학기초부문) 등을 수상한 바 있고 이번에 인체∙식물∙환경 마이크로바이옴과 더불어 대장균 세포공장을 비롯한 다양한 미생물의 유전체와 다중오믹스 시스템 분석 및 생명 진화 연구를 통해 생명과학과 시스템/합성생물학의 발전에 기여한 공로를 인정받았다. 이날 수상한 '연세 이윤재 펠로우십(Yonsei Lee Youn Jae Fellowship)'은 ㈜지누스 이윤재 이사회 의장의 기부금으로 운영된다. 지누스의 창업자이자 최대주주인 이윤재 회장은 우리 대학교 정치외교학과를 1975년에 졸업했다. 1979년 텐트업체인 진웅기업으로 출발한 지누스는 당시 세계 텐트 시장의 35%를 점유하고 매년 연평균 50%이상의 성장을 지속하여 1989년 코스피에 상장했다. 그러나 외환위기(IMF) 시절부터 경영악화를 피할 수 없어 결국 2005년 상장 폐지가 됐다. 이후 가구 사업으로 영역을 전환하며 자체 브랜드를 생산하여 온라인 유통망을 집중 공략하여 2015년부터 현재까지 아마존 판매 1위를 차지하며 상장 폐지 후 14년 만인 2019년 지누스는 재상장하며 ‘북미 온라인 매트리스 시장 1위’라는 타이틀과 함께 국내 시장에 복귀했다. [관련 기사 1] 연세 창립 139주년 기념식 개최 [관련 기사 2] 세상을 바꾸는 연대인들 (24) - 이윤재 지누스 이사회 의장
- 시스템생물학과 관리자 2024.10.04
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- 정효빈 교수, 유럽 분자생물학 연구소 (EMBL) 공동 연구팀 “노화 과정의 클론성 조혈증에 관여하는 모자이크 구조변이와 세포 분화에의 영향을 최초로 규명”
- 정효빈 교수, 유럽 분자생물학 연구소 (EMBL) 공동 연구팀 “노화 과정의 클론성 조혈증에 관여하는 모자이크 구조변이와 세포 분화에의 영향을 최초로 규명” 시스템생물학과 정효빈 교수는 유럽 분자생물학 연구소 (EMBL, 독일 하이델베르크) 와의 공동 연구를 통하여 사람의 노화 과정에서 조혈모세포가 어떤 모자이크 구조 변이를 획득하는지 landscape을 파악하고 구조 변이 클론의 세포 타입 조성을 조사함으로써 모자이크 구조 변이의 기능적 영향을 탐색하였다. 이를 통해 TET2, DNMT3 등의 유전자에 생기는 단일염기 변이 뿐만 아니라 AR, SREBF1, NF1 등을 수반한 모자이크 구조변이가 클론성 조혈증에 관련될 수 있으며, 세포 분화 기전에 영향을 줄 수 있음을 새롭게 제시하였다. 이 연구는 Nature Genetics 저널에 2024년 6월 게재되었다. (“Cell-type-specific consequences of mosaic structural variants in hematopoietic stem and progenitor cells” Nature Genetics (2024) doi: 10.1038/s41588-024-01754-2) 본 논문은 2023년 해당 연구팀이 최초로 개발한 단일세포 구조변이-후성유전체 통합 분석 생명정보 기법인 scNOVA (doi: 10.1038/s41587-022-01551-4)가 Case study 뿐 아니라 실제로 확대된 코호트에서 체성 모자이크 변이와 관련된 다양한 생물학적 질문에 답하기 위해 적용될 수 있음을 시사하였다. 이와 같은 경험을 토대로 정효빈 교수 연구팀은 본 연구에서 개발된 생명 정보 기법을 개선하고 새로운 코호트 데이터에 적용하여 종양내 이질성, 암의 진화에서 클론 증식의 분자적 기전 등에 대한 새로운 생물학적 발견에 도전할 계획이다. [그림] scNOVA 분석방법을 다양한 연령의 건강한 공여자 조혈모세포에 적용하여 클론성 조혈증을 일으킬 수 있는 구조변이 landscape와 세포 분화에 미치는 영향을 탐구한 모식도
- 시스템생물학과 관리자 2024.09.20
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- 서동혜 (시스템생물 02) 동문의 겐트대학교 글로벌 캠퍼스 교수 임용
- 서동혜 (시스템생물 02) 동문의 겐트대학교 글로벌 캠퍼스 교수 임용 서동혜 동문의 겐트대학교 글로벌 캠퍼스 임용이 확정되었다. 2024년 8월부터 겐트대학교 글로벌 캠퍼스 생명과학부 분자생명공학과 내 식물생명공학센터 (Plant Biotechnology Research Center)에서 근무를 시작하였다. 2002년 연세대학교 이과대학에 입학해 시스템생물학과를 졸업하였으며, 2007년부터 동대학원 김우택 교수님 연구실에서 석박사통합과정을 통하여 박사학위를 수여받았다. 2016년부터 미국 PURDUE 대학교의 윤경미 교수님 연구실에서 박사후연구원 기간을 보냈으며, 2019년부터는 연세대학교 김우택 교수님 연구실로 돌아와 생명시스템연구원 소속 연구교수로 연구를 이어나간 바 있다. 학부 과정동안 김우택 교수님의 식물분자생리학 수업을 들으면서 수업 중간중간 말씀해주신 진행중인 연구에 대한 소개를 들으면서 식물 연구에 대한 새로운 시각을 가지게 되었다. 이에, 김우택 교수님 연구실에서 식물의 스트레스 호르몬인 앱시스산의 신호전달 기작에 관한 연구를 진행하였으며, 스트레스 저항성 관련 유전자를 발굴하고 이를 작물에 적용시킴으로써 분자생물학을 기반으로 하는 식물 연구가 실제로 농업 발전의 기반이 될 수 있음을 익힐 수 있었다. 윤경미 교수님 연구실에서는 식물의 생장 및 과실의 후숙을 유도하는 가스 형태의 호르몬인 에틸렌의 신호전달기작을 규명하는 연구를 진행하였다. 연세대학교에서 연구교수로 재직하면서, 식물의 진화 과정에서 중 첫 육상 식물인 우산이끼에서 환경스트레스 대응 유전자를 발굴하고 그 기능을 규명하는 연구를 이어나갔다. 겐트대학교 글로벌 캠퍼스에서는 식물이 환경 스트레스에 적응하기 위해 발달시킨 기작들과 호르몬 신호전달기작의 확립 과정에 대하여 분자진화적인 관점에서 연구할 예정이다.
- 시스템생물학과 관리자 2024.09.06
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- 안희경 (시스템생물 08) 동문의 에든버러 대학교 교수 임용
- 안희경 (시스템생물 08) 동문의 에든버러 대학교 교수 임용 안희경 동문의 에든버러 대학교 임용이 확정되었다. 2024년 11월부터 에든버러 대학교 생명과학부 내 식물분자생물학 연구소 (Institute of Molecular Plant Sciences)에서 근무하게 된다. 여기에 런던왕립학회에서 수여하는 University Research Fellow에도 선정되었다. 전 과학 분야에 걸쳐 해마다 30명 정도를 뽑는 URF는 학문후속세대에게는 가장 권위있는 펠로십으로 8년간 총 180만 파운드 (한화로 약 30억원)을 지원받게 된다. 2008년 연세대학교 생명시스템대학에 입학해 시스템생물학과를 졸업했고, 부전공으로 사학을 수료했다. 2011년부터 동대학원 배현숙 교수님 연구실에서 석박사통합과정을 지냈다. 2018년 4월부터 영국 노리치 The Sainsbury Laboratory (TSL)의 조나단 존스 교수님 연구실에서 박사후연구원 기간을 보냈다. 어려서는 식량 자원이라는 측면에서만 작물에 관심을 가졌으나, 우연한 기회에 배현숙 교수님 연구실에서 학부 연구생으로 지내면서 식물을 연구하는 것 자체에 매력을 느끼게 되었다. 특히 여러 단백질이 한데 모인 복합체를 연구하면서, 세포 내 단백질 복합체 형성 및 유지에 관심을 갖기 시작했다. 존스 교수님 연구실에서는 병원균을 인식하는 식물 세포 내 수용체 연구를 진행했다. 특히 박사과정 연구를 기반으로 병원균을 인식하는 세포 내 수용체가 다양한 형태의 복합체를 이루는 것을 보였다. 에든버러 대학교에서는 이 수용체가 복합체를 형성하는 원리를 밝히고 이를 바탕으로 새로운 병원균 수용체를 찾아내는 방법을 연구할 예정이다.
- 시스템생물학과 관리자 2024.06.27
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- 정지연(시스템 생물 03) 동문, 하버드대 교수 임용
- 정지연(시스템 생물 03) 동문, 하버드대 교수 임용 정지연(시스템 생물 03) 동문이 2023년 1월 하버드대 교수로 임용되었다는 낭보가 들려왔다. 학부에서 생물학 공부를 시작한 지 20년 되는 해에 하버드대 교수가 되었다. 정 동문은 연세대학교에서 시스템 생물학과 학사와 석사 학위를 받고 예일대에서 박사 학위 취득 후 교수 임용 전까지 하버드 의과대 박사연구원으로 활동했다. 정 동문이 연구자와 교수자의 길을 걷게 된 시작은 학부 때 시스템생물학과 정인권 교수의 바이러스학 강의로 거슬러 올라간다. 그 때 그 수업이 너무 재미있어서 대학원에서도 정인권 교수 연구실에서 공부하고 박사 유학까지 하게 되었다. 정 동문은 “연구에 있어 개개인의 독립성을 이끌어 주셨던 정인권 교수님 덕분에 연구를 재미있게 해왔다. 그 결과가 지금의 나를 만들었다”고 회상하며 “정인권 교수님을 롤모델로 삼고 학생들을 지도하고 연구 활동을 해나가고 싶다”고 했다. 정지연 동문은 앞으로 뇌 안에서 지방이 저장되고 사용되는 메커니즘을 연구함으로써 치매와 파킨슨병 등 뇌 질환의 새로운 해법을 제시하려고 한다. 사람들은 보통 지방을 다이어트와 연관 지어 생각하지만 정 동문은 다이어트보다는 뇌과학적 측면에서 지방의 중요성을 주목한다. 보이지 않지만 뇌 안에도 여러 지방이 존재하고 지방이 과하거나 부족하면 큰 문제가 일어난다. 이 과정에서 지방질이 뇌에서 어떤 역할을 하고 또 어떻게 신경계에 영향을 미치는지 연구할 예정이다. 정 동문은 ‘진리가 너희를 자유케 하리라’는 연세 정신을 소중한 격언으로 받아들여왔다 왜냐하면 스스로 좋아하는 학문이나 일에 몰입하면 그 과정이 아무리 힘들어도 그 속에서 즐거움, 나아가 자유를 느낄 수 있기 때문이다. “연세 정신의 핵심을 ‘과정을 즐겨라’로 해석한다”는 정 동문은 “지금 연구하는 학문의 진리로부터 즐거움을 느껴 보기를 바란다. 그러면 좋은 결과는 자연스럽게 따라 온다”는 말로 후배들에 대한 조언을 전했다.
- 시스템생물학과 관리자 2024.06.03
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- 양성욱 교수 연구팀, Hoogsten DNA-은나노 클러스터 센서가 표적 miRNA와 결합 시 적색 형광을 방출함을 규명
- 양성욱 교수 연구팀, Hoogsten DNA-은나노 클러스터 센서가 표적 miRNA와 결합 시 적색 형광을 방출함을 규명 시스템생물학과 양성욱 교수 연구팀은 덴마크 Roskilde University Pratik Shah 교수 연구팀, 본교 양원호 교수 연구팀과의 공동 연구를 통해 Tailed-Hoogsteen 삼중 DNA 기반 은나노클러스터가 표적 miRNA 탐지와 결합, 빨간색 형광을 방출함을 규명하였다. 은나노클러스터(AgNCs)의 Hoogsteen 삼중 DNA 구조를 사용하여 타겟 miRNA를 세포 외 탐지하거나, 세포내 이미징이 동시에 가능한 기술이다. 본 연구는 그 우수성을 인정받아 Small 지에 2023년 11월 온라인 게재되었다. (Tailed-Hoogsteen Triplex DNA Silver Nanoclusters Emit Red Fluorescence upon Target miRNA Sensing. Small (IF: 13.3). 15th Nov 2023. Online ahead of print. https://doi.org/10.1002/smll.202306793). 본 연구에서 저자들은 Tailed-Hoogsteen 삼중 DNA에 싸인 은나노클러스터(DNA/AgNC)를 사용하여 표적 miRNA를 감지하는 새로운 방법을 제시하였다. 센서 끝에 달려 있는 tail 염기서열은 miRNA와 상보적이며, 이 tail과 miRNA가 결합할 시 Tailed-Hoogsteen 삼중 DNA/AgNC는 뚜렷한 빨간색 형광을 방출함을 확인하였다. 다음으로 이 miRNA 센서가 세포에서 추출한 전체 RNA 속에서도 표적 miRNA를 효과적으로 탐지함을 확인하였다. 이어서 양원호 교수 연구팀의 도움으로 대장암 세포주 내에 miR-21을 탐지할 수 있는 센서를 도입하였고, 그 결과 DNA/AgNC 기반 센서를 이용한 이미징을 최초로 성공하였다. 이는 기존의 DNA/AgNC 기반 miRNA 센서들이 주로 turn-off mechanism을 가지고 있어 세포 이미징에 적용하기 어려웠다는 점과 비교했을 때 본 연구팀이 개발한 센서가 갖는 큰 장점이라고 할 수 있다. 또한 본 연구팀은 젤 전기영동 기반 형광 분석 및 SAXS(소각 X선 산란) 분석을 통해 Tailed-Hoogsteen 삼중 DNA/AgNC가 표적 miRNA 탐지, 결합 시 단량체에서 이량체로 변함을 확인, turn-on 센서의 형광 방출 메커니즘을 규명하였다. 종합적으로, 본 연구 결과는 Tailed-Hoogsteen 삼중 DNA/AgNC가 in vitro 이미징 및 세포 내 이미징 모두에서 miRNA 탐지를 위한 효율적인 센서로서 이용될 수 있음을 시사한다. 공동 제1저자 Hari Chandana Yadavalli 학생, 박수연 학생 Small논문 모식도 참여 저자: Hari Chandana Yadavalli†, Sooyeon Park†, Yeolhoe Kim, Tae-Hwan Kim, Min Kyun Han, Il Lae Jung, Yong Joo Bhang, Won Ho Yang, Louise Torp Dalgaard, Seong Wook Yang*, Pratik Shah* (†: 공동 제1저자, *: 교신저자)
- 시스템생물학과 관리자 2023.11.20
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- 허지원 박사, 충남대학교 생명정보융합학과 임용
- 허지원 박사, 충남대학교 생명정보융합학과 임용 생명시스템대학 시스템생물학과 미생물유전체학 및 시스템/합성생물학 연구실(김지현 교수)의 연구교수인 허지원 박사의 충남대학교 생명시스템과학대학 생명정보융합학과 소속 전임교원으로 임용이 확정되었다. 허 박사는 2023년 9월 1일부터 마이크로바이옴 전공 분야를 담당하는 조교수로 근무하게 된다. 허지원 박사는 포스텍에서 면역학 박사학위를 받은 후 생물정보학으로 연구분야를 전환하였으며, 2020년 김지현 교수 연구실에 합류하여 인체 마이크로바이옴과 질병의 연관성에 대한 연구를 담당하였다. 허 박사는 '대장암 환자의 분변 미생물을 활용한 예후 예측' 및 '젊은 마우스 유래 장 미생물군집을 통한 늙은 마우스의 노화개선' 연구를 성공적으로 수행하여, 지난 해 해당 분야의 세계적 학술지인 Microbiome (JCR 2022 IF 15.5)에 두 편의 논문을 게재하였다. 한편, 김지현 교수의 미생물유전체학연구실에서는 권순경 연구교수가 지난 2019년 3월 1일 경상국립대학교 자연과학대학 생명과학부에 미생물유전체학 전공 조교수로 부임하여(현재 부교수) 시스템미생물학연구실을 이끌고 있다.
- 시스템생물학과 관리자 2023.07.19
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- 김지현 교수, 한국미생물·생명공학회 학술대상 수상
- 김지현 교수, 한국미생물·생명공학회 학술대상 수상 생명시스템대학 시스템생물학과 김지현 교수는 2023년 6월 22일 경주화백컨벤션센터에서 개최된 '2023년 학회 창립 50주년 기념 국제학술대회 및 정기학술대회' 정기총회에서 대장균 세포공장을 비롯한 다양한 미생물의 유전체와 다중오믹스 시스템 분석 및 생명 진화와 마이크로바이옴 연구를 통해 미생물유전체학과 시스템/합성생물학 및 학회의 발전에 기여한 공로로 학술대상을 수상했다. 김지현 교수는 2000년부터 학회의 정회원으로 활동하면서(2009~현재, 평의원), Journal of Microbiology and Biotechnology Editor (2005~2007), 학술간사(2014), 재무간사(2015), 감사(2018), 학술진흥위원장(2021), 이사(2023) 등을 역임하며, 미생물유전체전략연구사업(2014~2022) 단장으로서 지속적으로 학술대회를 후원하고 심포지엄 세션을 운영하는 등 학회의 발전을 위해 헌신적으로 봉사해왔을 뿐만 아니라, J. Microbiol. Biotechnol.에 게재한 교신저자 논문 2편(2017, 2020)을 포함하여 미생물 유전체 분석과 기능 및 진화 연구(Trends Genet 2001; Nucleic Acids Res. 2005, 2007; Nature 2009; Genome Biol. Evol. 2013; Nat. Commun. 2016), 대장균 세포공장의 유전체 및 다중오믹스 시스템 분석(J. Mol. Biol. 2009; Genome Biol. 2012), 마이크로바이옴 연구(Nat. Biotechnol. 2018; Gut 2021; Microbiome 2021, 2022a, 2022b)를 비롯한 연구/리뷰 논문 120여 편, 특허 및 프로그램 등록 50여 건 등 미생물·생명공학 분야에서 이룩한 탁월한 연구업적은 국가연구개발 우수성과 100선(2010, 2019), 교육과학기술부 장관상(2011), 과학기술정보통신부 장관표창(2019), 대통령표창(2022)과 대한민국학술원상(2019) 등의 수상을 통해 검증된 바 있다.
- 시스템생물학과 관리자 2023.07.17