본 발명은 miRNA의 수준을 측정하는 제제를 유효성분으로 포함하는 자궁내막증의 진단용 조성물에 관한 것이다. 본 발명은 본 발명은 종래 자궁내막증이 갖고 있는 진단의 어려움 및 치료의 한계점을 극복하기 위하여 연구 노력하였다. 그 결과, 건강한 대조군과 자궁내막증 환자에서 분리한 자궁내막 세포에서 새로운 진단 타겟을 탐색하던 중 엑소좀 내 miRNA의 발현의 차이를 확인하였다. 건강한 대조군 보다 자궁내막증 환자에서 분리한 엑소좀 내 miRNA의 발현이 유의하게 증가 또는 감소함을 확인함으로써, 본 발명을 완성하게 되었다. 자궁내막증의 진단 및 치료제로써, 유용하게 이용될 수 있다.