본 발명은 데이터베이스 및 연산기능을 가진 제어서버에 의해 수행되는 해수면 온도편차 지속성 평가 시스템으로서, 일평균 해수면 온도 재분석장에서 기후값을 산출하는 기후평균 산출부(100); 일평균 해수면 온도 재분석장에서, 상기 기후평균 산출부(100)에서 산출된 기후값을 차감하여 일평균 해수면 온도 편차를 산출하는 온도편차 산출부(200); 상기 온도편차 산출부(200)에서 산출된 일평균 해수면 온도편차 시계열 데이터를 통해 지연자기상관계수를 산출하는 지연자기상관계수 산출부(300); 및 상기 지연자기상관계수로부터 해수면 온도의 지속성을 평가하는 지속성 평가계수를 산출하는 해수면 온도 지속성 진단부(400)를 포함한다.