카트리지형 바이오마커 분자진단 장치가 개시된다. 본 발명의 일 실시예에 따른 카트리지형 바이오마커 분자진단 장치는, PCR(Polymerase Chain Reaction)용 샘플이 투입되어 유동하는 카트리지와, 상기 카트리지가 안착되는 본체를 포함하고, 상기 카트리지는, 상기 샘플이 투입되는 투입구; 상기 샘플의 유동을 위한 압력이 유입되도록 배치되는 하나 이상의 압력 유입구; 및 상기 투입구를 통해 투입된 상기 샘플이 반응 광의 조사 시 열을 발생시키는 발열 물질, 프라이머(primer) 및 중합 효소와 혼합된 상태로 유동하거나 머무르는 반응 유로;를 포함하고, 상기 본체에는, 상기 하나 이상의 압력 유입구에 상기 샘플의 유동을 위한 압력을 공급하는 하나 이상의 압력 공급부; 및 상기 반응 유로의 적어도 일부분에 상기 반응 광을 조사하는 반응 광 조사부;가 배치되며, 상기 샘플이 상기 반응 유로의 내부에서 상기 반응 광을 조사받는 동안에는 상기 발열 물질이 열을 발생시켜 상기 샘플이 가열되고, 상기 반응 광을 조사받지 않는 동안에는 상기 발열 물질이 열을 발생시키지 않으며 상기 샘플이 냉각될 수 있다.