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본 발명의 유전자 서열 정렬 방법은 복수의 쿼리 서열을 획득하는 단계; 상기 복수의 쿼리 서열에 포함된 각 쿼리 서열에 대해 2 이상의 스레드(thread)를 할당하는 단계; 상기 각 쿼리 서열에 대해 할당된 스레드들의 처리 데이터를 공유 메모리로 전송하는 단계; 및 상기 복수의 쿼리 서열에 대한 처리가 모두 수행되면, 상기 공유 메모리에 저장된 복수의 처리 데이터를 글로벌 메모리로 전송하는 단계를 포함할 수 있다.
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