본 발명은 자가면역질환이 유도된 동물을 제조하는 방법 및 이를 이용하여 제조된 자가면역질환 동물모델을 제공한다. 본 발명의 동물 모델은 Cre-LoxP 시스템을 통해 자가항원 유전자를 도입하여 Cre 재조합효소의 처리만으로 원하는 시점에 자가항원의 발현을 유도함으로써 동물 내에서 자가면역질환의 병인이 되는 유효량의 자가항체를 효율적으로 생성할 수 있다. 본 발명은 누출 발현 및 면역 관용으로 인해 자가항체가 잘 생성되지 않는 종래의 자가항원 유도 방법들과 달리 단 한번의 TAT-Cre 재조합 효소 처리를 통해 지속적으로 유효량의 자가항원을 발현시킴으로써, 난치성 질환인 자가면역질환의 다양한 증상과 분자적 기전을 효율적으로 재연하는 우수한 동물 모델로 유용하게 이용될 수 있다.