본 발명에서는 데이터베이스로부터 제공받은 데이터를 이용하여 훈련 집합, 테스트 집합 및 검증 집합을 분리하여 설계하는 단계; 상기 훈련 집합을 이용하여, 머신 러닝 알고리즘을 기반으로 삼차성 부갑상선 기능 항진증의 위험을 예측하기 위해 필요한 최적의 특성 변수들을 선정하는 단계; 및 상기 최적의 특성 변수들을 구간화하고 상기 특성 변수들을 범주형 특성 변수들로 변환하여, 각 특성 변수의 구간 별 스코어가 결정되는 정수 기반의 삼차성 부갑상선 기능 항진증 예측 모델을 생성하는 단계;를 포함하는, 머신 러닝을 이용한 삼차성 부갑상선 기능 항진증 위험 예측 방법이 소개된다.