본 발명은 줄기세포와 조직 재생용 세포의 직접적인 접촉을 제거함으로써 줄기세포의 조직 세포로의 분화능 또한 명확히 확인할 수 있는 공배양용 하이드로젤 스캐폴드 및 이의 제조방법에 관한 것이다. 특히, 조직 재생용 세포를 감싸고 있는 마이크로비드를 줄기세포와 함께 벌키 하이드로겔에 함께 배양하도록 제작된 3D 하이드로겔 스캐폴드로 안정적이고 효과적으로 조직 재생용 세포의 생존율과 기능성을 보존하여 조직 재생용 세포가 분비하는 여러 가지 단백질 분자들의 영향으로 줄기세포가 조직 재생용 세포로 분화하여 조직을 형성하도록 유도하였다.