본 발명은 비스포스포네이트-연관 악골괴사증(BRONJ, Bisphosphonate-Related Osteonecrosis of Jaw) 진단을 위한 유전자 마커(gene marker)의 용도에 관한 것이다. 보다 상세하게는, 본 발명은 정상인 대비 비스포스포네이트 연관 악골괴사증(BRONJ) 환자 내 우세한(prevalence) 23가지 유전자 마커의 변이를 검출하여 BRONJ의 발병 위험도를 진단 및 예측하는 방법에 관한 것이다.본 발명에 따른 유전자 마커의 변이를 측정하여 검사 대상의 BRONJ 발병 위험도에 대한 정보를 제공할 수 있다. 특히, 본 발명에 따른 23가지 유전자 마커의 변이를 측정함으로써 검사 대상에서의 BRONJ 발병 위험도를 예측할 수 있고 고위험도 BRONJ를 진단할 수 있으며, 골다공증 환자 유래 시료 및 BRONJ 환자의 유래 시료의 유전자 마커 및 신호전달 경로의 비교를 통해 골다공증 환자 중에서 BRONJ 환자로 발전될 가능성이 있는 골다공증 환자를 예측할 수 있다.