본 발명은 마일리지 할당 및 대기 순번제를 이용한 온라인 수강신청 방법에 관한 것으로, 다수의 수강신청 단말 및 마일리지 수강서버로 구성된 수강신청 시스템을 사용하는 온라인 수강신청 방법에 있어서, (a) 상기 마일리지 수강서버가 다수의 수강신청자에게 학기당 수강신청 허용학점에 따른 총 마일리지를 부여하는 단계; (b) 각 수강신청자가 수강신청 단말을 통해 상기 마일리지 수강서버에서 제공되는 수강신청 과목 대상에서 수강과목을 선택하는 단계; (c) 상기 각 수강신청자가 수강신청 단말을 통해 선택한 각 수강과목에 상기 총 마일리지의 적어도 일부를 배분하여 할당하는 단계; 및 (d) 상기 마일리지 수강서버가 각 수강과목에 할당된 동일과목의 상기 각 수강신청자의 수강신청 마일리지를 비교하여 수강을 허가하는 단계를 포함한다.이와 같은 본 발명은, 특정 시점에 집중되는 현상과 수강과목의 비교육적인 매매 현상 등의 부작용 문제가 발생하는 종래의 선착순 온라인 수강신청 방식의 폐해를 방지하고, 신청자의 수강권 및 자율권을 최대한 보장하고, 공정하고 합리적인 기준을 적용하여 학생 불만을 최소화시킬 수 있는 개선된 온라인 수강신청 방법을 제공한다.