본 발명은 발효폐기물로 제조한 섬유형 생체흡착제를 이용한 금속 회수 공정에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 음이온성 흡착제의 성질을 가지는 섬유형 생체흡착제의 물리화학적 특성을 고려하여 컬럼내 pH를 5~6으로 조절 가능한 내부순환형 컬럼공정을 이용해 수계에 음이온으로 존재하는 금속 이온을 회수하는 공정에 관한 것이다. 본 발명에서 제공하는 내부순환형 컬럼공정을 이용해 장기간 섬유형 생체흡착제의 손상을 최소화면서 95% 이상 고효율로 금속 이온을 회수할 수 있다.