본 발명은, 자성비드를 부착하여 순환종양세포의 크기를 증폭하고, 미세유체칩을 이용하여, 작은 크기의 혈구세포들은 통과시키고, 자성비드가 부착된 순환종양세포만을 포획하며, 포획된, 자성비드가 부착된 순환종양세포에서, 자성비드가 특정 파장의 레이저를 흡수하여 내는 열에 의해, 세포가 용해(lysis)되어 바이오마커가 추출되며, 추출된 바이오마커는 형광표지된 항체에 의해 확인되도록 이루어진, 자성비드와 광열효과를 이용한 순환종양세포의 포획 및 바이오마커의 추출을 위한 장치 및 방법에 관한 것이다. 본 발명은, 순환종양세포 시료와 자성비드를 튜브에 넣어 교반하여, 자성비드를 순환종양세포에 부착하고, 자성비드가 부착된 순환종양세포를 포함하는 순환종양세포 시료를, 다수의 공극을 가진 필터로 이루어진 미세유체칩을 통과시켜, 자성비드가 부착된 순환종양세포를 포획하고, 포획된 자성비드가 부착된 순환종양세포를 포함하는 미세유체칩으로, 레이저를 조사하며, 자성비드가 레이저를 흡수하여 내는 열에 의해, 순환종양세포가 용해(lysis)되어 바이오마커가 추출되고, 순환종양세포가 용해(lysis)되어 바이오마커가 추출되어 있는 미세유체칩으로, 형광표지 된 항체를 흘려주어, 바이오마커가 확인되도록 이루어진 것을 특징으로 한다.