EMR(electronic medical record) 시스템에서 임상 데이터를 검색하는 방법이 개시된다. 상기 방법은, EMR 시스템을 통해 작성된 임상 문서를 구조화된 항목에 따라 분류하여 데이터베이스에 저장하는 단계와; 사용자의 선택에 따라 상기 저장된 임상 문서 중 하나 이상을 로딩하여 제1 화면에 표시하는 단계와; 상기 제1 화면 상에 임상 데이터 검색용 제2 화면을 나타내는 단계와; 상기 임상 데이터 검색용 제2 화면에 입력된 검색어 및 검색 조건을 기초로 검색 쿼리(query)를 생성하는 단계와; 상기 생성된 검색 쿼리를 상기 데이터 베이스로 전송하여 임상 데이터 검색을 요청하는 단계와; 상기 데이터베이스로부터 상기 검색 쿼리에 대응되는 임상 데이터를 수신하여 표시하는 단계를 포함할 수 있다.