본 발명은 전자건강기록기반 진료패턴의 표준화 시스템 및 방법에 관한 것이다. 본 발명은 각 의료기관의 의료정보가 저장된 의료정보 저장소와, 의료정보를 메타데이터와의 매핑을 통해 변환시키는 메타데이터 변환엔진을 포함한다. 그리고, 변환된 메타데이터가 프로세스 별로 저장되는 데이터 웨어하우스가 더 포함한다. 데이터 웨어하우스에 저장되어 있는 프로세스는 다수의 패턴으로 패턴화하여 알고리즘으로 생성된다. 이와 같은 본 발명에 의하면, 메타데이터 변환엔진을 통해 각 의료기관마다 메타데이터와의 매핑을 통해 각 의료기관마다 표준화된 진료패턴을 구축할 수 있는 효과가 있다.